los juegos van, pero siguen manteniendo las protecciones zonales, de hecho creo recordar que la ps2 tiene el motor de la ps1 también dentro, nada de emulación
las mejoras son un pequeño filtrado de texturas y unas mejoras de velocidad de lectura, lo que pasa es que por ej las mejoras de texturas descuadran los sprites (bof4, xenogears), y el aumento de velocidad de lectura suele hacer que los juegos se cuelguen por no acceder a los datos en el momento concreto (recuerdo que ff9 era una lotería, a veces cargaba, a veces no)
pero generalmente funcionan, aunque no se nota diferencia apenas