Por lo que tengo entendido (nunca he instalado un chip, pero si visito a menudo estos foros), los chips de PS2 no te joden la consola (salvo excepciones de algunos que son realmente malos).
Sin embargo, la instalación de un chip de PS2 (uno autónomo), es bastante más complicada de lo que era en PS1, y una instalación mal hecha SÍ puede cargarse la consola. Hay que tener mucha experiencia y haber instalado unos cuantos chips de PS2 para asegurarse de que no se va a joder la consola.
También hay otro problema, y es que las PS2 (el lector sobre todo), son de muchísima peor calidad de lo que eran las PS1, y se acaban jodiendo a los pocos años. Mucha gente sin chip hemos tenido problemas con el lector (conozco a más gente con PS2 con problemas que sin problemas).
Saludos.