Te respondo al tema de la compatibilidad con NDS del PRO.
Hay una opción de parcheo que se llama "Normal", que funciona de la misma forma que funciona los juegos de la GBA; carga en memoria la ROM y luego la ejecuta. Hay ciertos juegos (alrededor de 8) que sólo funcionan parcheándolos en modo NORMAL. El problema es que el cartucho M3 PRO sólo tiene 4MB de RAM en vez de 32 como tiene el PERFECT. Así que sólo funcionarán las ROMs en modo parcheado "Normal" que no supere los 4MB.
Ya se ha comentado que los juegos que sólo podían ser ejecutados en modo Normal se podía también ejecutar en "SAFE MODE" y así funcionaría también en la versión PRO.
Te recomiendo comprar el PERFECT, ya que nunca sabrás si en un futuro sólo podrás parchear en NORMAL como pasó durante cierto tiempo con algunas ROMs en SAFE MODE.