Mi consejo es que probéis los 2 y decidáis por vosotros mismos. El firmware "viejo" (ver. 3.9) soporta homebrew sin problemas, Sakura sin embargo durante el proceso de hackeo perdió cierta compatibilidad con homebrew, funcionando sólo alguna de las aplicaciones disponibles. Eso sí, el que sólo esté interesado en juegos de la DS (y GBA) con Sakura no tendrá ningún problema, al igual que con el firmware "clásico".
Por otro lado Sakura es más rápido, más bonito y ofrece mayores prestaciones (siempre manteniendo en mente que lo de bonito es una cuestión subjetiva y que hay algunas cosas que aún no funcionan - mayormente el soft reset), pero oficialmente sólo se ha lanzado en japón y para los flashcart japoneses (de ahí que haya sido necesario el hackeo y traducción).
Pues nada, lo dicho... lo mejor es probarlos y después decidir, que no váis a perder nada y las partidas salvadas son completamente compatibles.
Un saludo
P.D. Un par de posts más abajo encontraréis un hilo creado por mí que incluye el link para descargar el Sakura en español, por el momento es el único sitio donde lo váis a encontrar pues oficialmente aún no ha sido lanzado.