Vale ya he hecho algunas pruebas, y me parece que son las apps. Probar Twitch, va perfecto, poned alguna retransmisión de algún juego que vaya a 30 fps constantes (alguno de consola como Destiny) y veréis que va perfecto. Me da a mí que las apps tienen que actualizarse con los nuevos SDK, o programarlas mejor, pero algo deben tener porque repito Twitch va siempre perfecto. YouTube sí que pega unos tirones horrendos, siendo de Google no me extraña nada.
Otra cosa a tener en cuenta respecto a la TV, es que nuestra TV es a 50Hz (25 fps) y mientras jugamos el modo del TV es 60Hz, por lo que a pantalla completa la TV podrá conmutar a modo 50Hz pero acoplada se tiene que poner a 60Hz, lo que implica conversión de tasa de frames (25 fps -> 60 Hz). De ahí que diga que probéis Twitch con algún juego que vaya a 30 fps constantes, para evitar conversiones.