con el romcenter abres el .dat que viene con el emu, y te genera una base de datos con los juegos que soporta.
Luego añades las carpetas donde tienes los juegos y le das a scanear, te dice los que estan bien, los que se pueden arreglar y los que no conoce y tal. si le das boton derecho sobre la carpeta y arreglar, se pone a actualizarte las roms para que esten lo mejor posible (en cuanto al dat que has puesto, esto puede tardar mucho dependiendo de cuantas roms tengas y/o lo grades que sean) . Luego sacas las que estan en verde, las pones en la carpeta roms del emu y a jugar.
Ah siempre haz un backup de las roms antes de usar el romcenter, al arreglar las roms borra morralla, cambia cosas, etc.