supongo q esto te pasa al cargar un juego de ps2...
pulsa el boton ps del sixasis y cambia la asignación de los mandos (1,2...), una vez q el mando pare de vibrar(el de ps2, claro), dale a apagar este mando (el sixaxis).
A mi me pasaba en los menús de Resident Evil 4. Si lo q he escrito no te resulta, haz distintas pruebas cambiando la asignación del mando y desconectando el dualshock2 y volviéndola a conectar. Suerte.
Saludos!