No tengo PS4 (ni su mando) así que solo hablo de oídas (o leídas, en este caso), pero tengo entendido que la compatibilidad del DS4 con PS3 es existente, pero limitada: hay bastantes juegos en los que no funciona así que tampoco me extrañaría que ciertas funciones, como la detección de movimiento, diesen problemas.
Si el mando funciona bien en PS4, no trastearía más..... simplemente la compatibilidad es incompleta.