Otra pequeña diferencia puede ser que hay distribuciones que por defecto usan el usuario que te creas al instalar el sistema como root, y otras que crean aparte un root. Por ejemplo Ubuntu, Mint y derivadas para instalar algo usas:
sudo apt-get install xxx
En otras como Debian, o las derivadas de RedHat, primero haces su, y luego apt-get install xxx, y la pass de ese root es una aparte de la de tu usuario. Por ejemplo.
Aunque se puede cambiar esto fácilmente. Supongo que tiene más seguridad usar un root aparte, y por contra es más cómodo usar el root como tu usuario.