Yo me di de alta como autónomo en diciembre y pude aprovechar la tarifa plana. La cosa es que, al hacerlo a medio mes, no me cobraron hasta finales de enero; el problema fue que, además de los 60€ correctos por el mes de enero, me cobraron 251€ por los días dados de alta en diciembre. Fui a la seguridad social y me explicaron cómo hacer la gestión desde la web (ni lo recuerdo, eran muchos pasos y muy engorroso, la burocracia en España...) y a los pocos días me llegó una notificación en PDF de que me reembolsarían 205€, quedándose esos 46€ restantes como lo correspondiente a lo que tenía que pagar. Eso sí, todavía no los he visto en mi cuenta. Imagino que será a final de mes.
En fin, una gracia que por una cagada suya tengas que hacer gestiones varias y esperar, en mi caso, hasta 3 meses para tener de vuelta tu dinero. La alegría de ser autónomo...