Creo que tu mayor problema es la sugestion, pensar que estas enfermo y tu cerebro acaba imitando algunos sintomas de "alerta", no pondria la mano en el fuego pero apunta a ansiedad, y la ansiedad te hace creer eso precisamente, que estas enfermo.
Cuando te pase algo asi inventate un boton magico en la cabeza, por ejemplo, cuando te ocurra ese pensamiento enfocalo a que es ansiedad y estres, que se ha parido de ahi, eso te va a ayudar mucho.
Lo de despertarse deshorientado creo que le pasa a bastante gente, a mi alguna vez me paso, de despertarme y no saber donde esta la ventana, la puerta... durante unos segundos, se va al instante de encender la luz, yo creo que es que hemos recuperado la consciencia en alguna fase del sueño y pasan cosas raras..
Si te preocupa bastante vete a un especialista, de una mala te quitara esa sugestion de pensar que se te va la olla.