Las diferencias son que las Palm corren un sistema operativo llamado PalmOS y los PocketPC una versión de Windows para dispositivos móbiles llamado Windows CE. Las Palm suelen tener procesadores menos bestias y menos memoria, porque al ser el sistema operativo menos pesado, tampoco lo necesitan.
Lo que tienes que hacer es mirar qué sistema operativo te gusta más y cuál tiene aplicaciones que se adaptan mejor a ti.
Yo tengo una Palm, pero hoy en día casi que recomendaría un Pocket PC porque cada vez le está comiendo más y más mercado.
Por cierto, huye de Acer como la peste. Si no es la empresa con peor soporte técnico del planeta, no andará lejos.