Si, Sonora es una marca típica de principiante, de gama baja, pero te irá muy bien para aprender y podrás hacer tus pinitos durante un par de años. Creo que es lo ideal para un principiante, luego cuando tengas más claro por dónde quieres tirar, cómprate una mejor según vaya evolucionando tu estilo (ej. puede que cuando empieces en serio te des cuenta de que te gusta el metal o el blues, para cada estilo hay un estilo de guitarra apropiado). Échale un vistazo a las Academy, que son también típicamente de principiante.
El ampli, con 10W para tocar en casa vas que te matas. A menos que tengas planeado juntarte con una batería no necesitas más, y aún así te podrías arreglar. Los amplis hacen MUCHO ruido, incluso con 10W dudo que lo uses a más del 30% del volumen.
Los pedales se usan para añadir efectos, y no son en absoluto necesarios, y no tienen nada que ver con los armónicos.
La ganancia digamos que es la "potencia" del sonido (que no el volumen). En algunos amplis, ganancia=nivel de distorsión, en otros va por separado, pero digamos que cuanto mayor sea la ganancia, más "lleno" y fuerte sonará. Y sí, aquí cuanta mayor ganancia pongas, más sonarán los armónicos.
Lo de las ruletillas da un poco igual. Normalmente hay una o varias que controlan el volumen y otra(s) para el tono. El hecho de que haya una o dos sólo suele implicar que ese control se aplica para cada pastilla. Esto es un detalle sin importancia, ni te fijes en eso.