A nivel de usuario el mayor cambio es que graban la partida de otra manera, pero se pueden traspasar.
La wii-u no admite tarjetas de gamecube, con lo que es emulada si o si.
Por lo demás, es instalarlos y elegir el que quieras en el loader. Hazlo antes con la wii, porque para comprobar tu copia con devolution necesitas hacerlo con una wii (si no ha cambiado la cosa).
De todos modos, lee al menos el wiki de cada uno.
Con los juegos de wii, recordarte que puedes copiar las partidas. La mayoría funcionan bien usando nand emulada en disco duro en modo parcial. Puedes hacerlo con el loader o con SaveGameManagerGx