Son independientes pero lo pueden resolver, igual que si compras en un MM y lo devuelves en otro.
A mi me pasó exactamente lo mismo, compré un juego, cancelé, me hicieron la cancelación y no se hizo efectiva, el juego me lo cobrarón ese mes, dejé pasar un tiempo porque coincidió que era el final del periodo de facturación, al mes siguiente nada, llevé todo y me hicieron la devolución con la tarjeta de MM que tarda alrededor de unos 50 días, me dijeron que si fuera una tarjeta normal es inmediato.
Es un fallo de la pasarela de pago y que por desgracia es habitual.