Lógica, macho:
De que te serviría un listado de SD compatibles si tu mismo has comprado una de la misma marca y modelo y no te va?
Deja la de 32gb en el Everdrive y usa la de 16 o compra otra para la GBA.
Por cierto, yo hace años que no trasteo con flashcarts, pero no había que formatearlas en FAT32?