No hace falta q sean particiones extendidas, tb pueden ser primarias, eso si, piensa q no se admiten mas de 4 primarias.
Para tu disco (no dices la ram q tienes) yo particionaria solo para raiz, para home y para swap. La partición boot la dejaria dentro de raiz, ya q se suele dejar aparte por seguridad, pero en un pc de escritorio no hace falta.
Con una partición home aparte te aseguras de q si casca el sistema tus archivos y los de configuración de todas las aplicaciones van a estar ahí aseguradas para q reinstalaes el sistema de nuevo sin perder esos datos.
Yo dejaria 20 Gb para Home y 60 para raiz. Para swap dejaria de 128 mb a 512 (yo tengo 128 Mb con 1 gb de RAM y metiendole caña solo he llegado a usar un 2%)