Básicamente las que conozco son estas:
Alternate.es
izarmicro.net
coolmod.com
Alternate es "barata" por la gran variedad que tiene (básicamente tienen de todo donde elegir), pero a veces es "peligrosa" por su falta de seriedad en algun cambio de piezas o algo por el estilo (en mi caso nunca he tenido ningún problema y he comprado varias veces, pero me se de algunos que han acabado con las pelotas hinchadas)
Izarmicro no es tan barata, pero sin duda se ha llevado el premio a una de las tiendas mas serias de españa, jamás he leido un caso en el que se portaran mal. Además son de los que aceptan mas formas de pago (tarjeta de credito, contrarreembolso, paypal, transferencia e ingreso en cuenta)
Coolmod, en un principio, era solo una tienda de modding (cajas, neones, refrigeración líquida...) pero poco a poco han ido ampliando su stock y ya puedes llegar a montar un PC completo solo comprandoles a ellos. No tienen mucha variedad de hardware pero en cuanto a refrigeración y cajas tienen uno de los catalogos mas variados de estos lares.