ese error por lo que veo es mas bien que falla el emm386 o el gestos de memoria alta. Amos que es un fallo del el arranque del disquete/usb/cd de arranque que usas mas que de un problema con el lector
Prueba como te han dicho a cargar el sistema con otro diskete de arranque haber si se soluciona el problema.
Yo tenia puesto por aqui una imagen de un diskete que arrancaba con lo minimo(para veitar incompatibilidades) pero con usb para poder tener todo en un pendrive de manera cómoda para poder flasear. Si lo quieres te lo busco en un momento