Depende; hay efectos de Framebuffer que la Ps3 no tiene potencia suficiente para replicarlos a 720p, mientras que a la Ps2 se los "regalaba" su EDRAM, luego por mucha más resolución y mejor frame-rate que tengan los remasters te vas a perder esos efectos, que en algunos casos son parte importante del apartado artístico y ambietal.
Luego también ocurre que hay remasterizaciones que son una puta mierda como por ejemplo la de los Silent Hill; los cuales pierden contenido, o lo cambian por otro peor, o tiene bugs donde antes no había.
Son decisiones muy personales, pero yo 9 de cada 10 veces prefiero PlayStation 2, por la personalidad de sus gráficos.