eso va a gustos. yo prefiero tener un cartucho independiente para modo nds, y la la tarjeta de 3ds, destinarla para roms de 3ds, y juegos emulados inyectados, como pueden ser nes, snes, gb,gbc, gba...etc.
pero los de nds, los uso en un cartucho, y asi libero la otra sd de espacio. simplemente por eso. nunca he usado twilight, asi que no te puedo ayudar en cuanto a compatibilidad y eso. pero el cartucho si te digo que va como la seda, aunque yo uso otra flashcard. pero al uso, es lo mismo