Hoy he pasado varias backups en formato wbfs desde mi pc al hdd y se puede hacer perfectamente con el wii backup manager.
1º. Selecionas en la pestaña drive 1 tu llave usb
2º En la pestaña file le das a "add" y desde ahi puedes añadir el backup en el formato que quieras(iso,wbfs).
Es así de sencillo.