Bueno, despues de un dia de trabajo he conseguido hacer rular la MFE-distro desde la misma SD. Todavia no he retocado muchas cosas, solo he cambiado el kernel y he modificado el arranque para que busque en la SD y en el DVD el fichero "mfe-fs.bz2"; vamos que no puedes ver pelis de la SD, pero ya no necesitas tener el mfe-fs.bz2 en el DVD con el que arranques.
No se si alguien estara interesado en que publique ya lo que tengo, mi intencion es seguir hasta que se puedan ver pelis desde la SD y luego publicarlo.
Algo que me llama la atencion es el hecho de que tarda mas en cargar desde la SD que desde un DVD, no me ha gustado nada eso. Ya veremos cuando añada el soporte para montar y desmontar tarjetas.
PD: de todos modos, si alguien esta interesado que me lo diga y le mando el dol.