Lo mas sencillo seria que buscaras el Disk Manager para tu disco duro desde la Pag del fabricante, p.e. para Seagate es el DiskWizard y el SEA Tools. Este programa hace uso de las rutinas de autodiagnostico del disco duro, con esto sabars si es daño fisico o daño logico -algunos sectores que quedaron mal grabados-. O definitivamente formatea el disco duro y que lo formate HDL/HDA directamente.
Otra opcion son las HDL Tools.