Resulta que es el SSD el origen del problema. Este PC trae un issd para actuar como ssd cache. Por lo que sea se ha corrompido y nada más encender el PC la bios intenta interactuar con él pero no puede. Tras pasar x tiempo (un timeout supongo) lo ignora y continúa, iniciando Windows.
No puedo quitarlo porque anularía la garantía, no tengo acceso directo a él, tendría que desatornillar todo el portátil.
En la bios aparece listado por lo que sí que es detectado. Pero ni desde windows ni desde un live cd de linux aparece como disco por lo que no puedo formatearlo.
He estado leyendo y creo que me va a tocar llevarlo al SAT de nuevo...