Cualquier programa que instales, instalalo en la sd.
Si quieres que aparezcan en el menú de inicio, instalas un canal forwarder, pero buscalo en su página oficial, ya que si está mal hecho te dará problemas.
Uloader usa sus propios cios (222,223,224), y además miembro de EOL. Para instarlos, mira el wiki de cios.
Mi recomendación personal:
Priiloader, para bloquear las actualizaciones,
usb loader cfg (mod) para juegos de wii o gamecube, configura automaticamente los cios, entre otras cosas. Instala primero la oficial, y luego cambias el boot.dol por la versión mod.
Uloader para wiiware y consola virtual. Para máquinas antiguas, tienes emuladores.
En cuanto al disco duro, yo uso una partición en fat32 con cluster a 32. Se graban en wbfs, pero como formato de archivo, en la carpeta /wbfs
Echale un vistazo a modmii
https://code.google.com/p/modmii/. Puede considerarse el instalador oficial para wii. (hasta puede formatear el disco duro)
En cuanto a quemar dvd's, la wii sufre más con dvd que con un disco duro, y dan mucha guerra. Hoy en dia no merece la pena ni intentarlo.
Los discos que tengas, los puedes pasar al disco duro con el loader, suelen tardar entre 5 y 15 minutos, segun el juego.
El reproductor multimedia (wiimc) es buenisimo, superando a muchos aparatos dedicados.
Disfruta de los preparativos y del uso, y recuerda que lo mejor de la wii son los juegos originales y no violentos que tiene. Y para los violentos, el botón B es un gatillo.