hombre, te demoras menos vaciando la SD que esperando a que te respondan.
en todo caso, es relativo. según como esté formateada la SD puede que te sirva o que no en la WII.
copia todo en el ordenador, formatea en FAT16 o FAT32 (ahí ya tienes que probar) y metela en la WII.
después de eso, puedes copiar nuevamente el contenido original en la SD. Mientras no coincida ninguna carpeta/fichero entre los 2 directorios (el de la wii y el de la SD original), te servirá sin problemas para ambos casos.