es un poco largo de explicar, pero basicamente hablamos wbfs cuando nos referimos al formateo del disco duro o cuando hablamos del formato de fichero.
Formatear un disco duro en wbfs hace mucho que esta desaconsejado, porque se corrompe con facilidad, porque no hay herramientas especificas, porque no se ve desde tu sistema operativo de forma nativa y un sin fin de inconvenientes. Sin embargo, los juegos en un disco formateado en fat32 con archivos formato wbfs es lo que se esta haciendo ahora. Además, para jugar a juegos gamecube es imprescindible fat32, y creeme que hay juegos increibles.
Se que es un poco lioso leído, pero hay excelentes tutoriales aquí en elotrolado donde puedes leer sobre el tema un poco mas si quieres profundizar.