Vayamonos poniendo de acuerdo, cuando modificas el HDLoader se pasa a llamar HDLFP -HDLoader Fully Patchet-. HDloader solo existio una unica version.
Supongo ya habras intentado usar el resto de los MODOS, puede poner mas de uno activado, p.e. el 1 y 3.
Supongo lo mismo que ya revisaste la lista que hay de juegos compatibles con el HDLFP y HDA3.
Supongo que ya te aseguraste que el juego funciona bien desde el disco optico.
Si usas WinHiip debes de poner en la configuracion del programa si usara el sistema de archivos para ToxicOS o para HDLoader.
PD: Tambien soy americano y solo en cuba, estamos undidos -EU- y algo en México son muy fanáticos del Beisball
*******************************************************
Actualizando:
Estaba leyendo que en el MLB 2006 hay qu modificar el archivo SYSTEM.CNF para que funcione desde el disco duro.
Este es un simple archivo de texto que editas con el block de notas, con ISOBuster o con DVDDecrypter -MODO archivo- vuelcas todos los archivos del DVD del juego a una carpeta del disco duro. Abres el SYSTEM.CNF y en la seccion BOOT=cdrom../xxxx_xxx.xx;1 cambias el xxxx_xxx.xx -las x las pongo por que no se en particular que tendra tu archivo para el MLB2k7- por el nombre del archivo que debe de empezar como SLUS_xxx.xx que encuentres en los archivos que copiaste al disco duro. El archivo SYSTEM.CNF tiene escrito el nombre del archivo de programa que debe de arrancar la PS2.
Guardas el archivo SYSTEM.CNF y ahora en nero o en easyCD&DVD creas una compilacion nueva UDF/ISO y colocas los archcivos del juego, en NEro seleccionas el grabador virtual para crear un archivo imagen *.NRG en el disco duro. En WinHiip instalas el juego desd el archivo imagen *.NRG y quiza funcione.