Es lo mismo que el Trinket M0, un micro con usb host. La única ventaja puede ser el form factor, que posiblemente encaje mejor (El trinket no fue desarrollado para eso).
Y respecto a la instalación de 4 hilos, es imposible que sustituya al jig. Por lógica los 4 hilos son: VCC, GND, D+ y D-.
Para ser totalmente autónomo, mínimo tiene que tener opción de cablear el pin 10 del joycon derecho que simula el corto que hace el jig.
Yo tenía ganas de hacerme con un Trinket M0 (Tanto para dogle como para instalación), pero una vez con la licencia del SX OS y visto que con el PC está tirado y se lanza el payload muy de vez en cuando una vez tienes todo funcionando, no sé si pillarlo. Igual le hago un Dongle a un colega que no dispone de PC (y no quiere perder la garantía de la consola) y trasteo con él un rato.
Lo dicho, un mod del Trinket M0 simplificado, reducido y con el propósito específico de ser usado como modchip, ni bien ni mal, una opción más.
Edit: Igual hasta sale más caro este que el Trinket M0, depende de quién lo distribuya. Adafruit tiene un par de distribuidores en España que venden online.