Para pasar wav o mp3 a atrack 3 yo uso el sonicstage (software de sony).
Para modificar las fotos en formato PNG puedes usar cualquier software compatible con este formato. Yo por ejemplo uso uno gratuito y muy bueno llamado "Photofiltre", son pocos megas y tiene un pluying para ponerlo en español.
Sobre algun programa para ver los videos pmf me da que hasta ahora no hay nada para ello, ni para convertirlos. La unica utilidad que e visto es una que te permite recomprimir estos videos.
Pienso que algun reproductor puede haber pero al menos yo no lo conozco.