Si son 2 ventiladores de 5 V. podrías probar a conectarlos en serie; con lo que permitirían una caida de tensión de 10 V. y no creo que les pasara nada si en lugar de alimentarlos con 10 V. los alimentas con 12 V. como deseas.
Tendrías un 20 % de sobrealimentación, aumentaría algo las revoluciones y por consiguiente el caudal de aire. Si no deseas esa sobretensión puedes poner en serie tambien un par de diodos para que reduzcan en 2x0,6 V. los 12 V., con lo que tendríamos los ventiladores alimentados con 10,8 V.
Si estas interesado, y no me he explicado bien, podría hacerte un pequeño esquema.
Saludos.