Sí, claro, lo de abajo se borrará, xq en realidad lo de abajo "no existe". Con la herramienta del tampón, lo que haces es "copiar" lo de una parte a otra, lo cual viene bien xa reparar lo que se pierde al quitar las letras (no hay forma humana posible de recuperarlo).
Para quitar las letras, usas la varita mágica para seleccionarlas (o las seleccionas a mano) y las borras a saco. Luego con el tampón y con maña dibujando tú mismo, reparas la imagen. Por último, añades el texto. Si alguna parte te ha quedado mal, te aseguras de que el texto la tape.
De todas formas, lo que te aconsejo si no tienes experiencia con photoshop o sucedáneos (porque este arreglillo tiene su miga para que quede decente), es que directamente:
a) te quedes con la carátula en inglés
b) busca carátula en castellano, muchos grupos se dedican a hacerlas aunque la serie/película no exista en España
c) móntate tu propia carátula desde cero. Búscate una imagen similar a la que sale en la carátula(si encuentras la misma sin letras, mejor todavía) y ponle el texto que quieras