Apagar la consola de capón con el linux corriendo tiene las mismas consecuencias que apagar el PC con linux corriendo, date cuenta que es lo mismo. Todo el sistema de particiones esta montado, los servidores corriendo etc...
Tienes que hacer un
$shutdown -h now en la consola de linux cuando seas root, se desmonta todo, mata todos los procesos y a tirar, bastante rapido al menos el Gentoox.
Tu idea de utilizarlo para el emule es bastante cojonuda, mas que nada por el motivo del ruido, yo tengo el servidor de casa en otra habitación por este problema. Lo que me da miedo, es que la consola no creo que esté preparada para darle ese tute, en mi caso, yo no apago el servidor nunca....
Hagas lo que hagas, asegurate que la consola no tenga activada la opción de apagarse sola a las 6 horas de inactividad (en el dashboard de M$), no se si la bios de Xecuter deshabilitará esto o no, pero por si las moscas por el tema del linux.
Te recomiendo montar el mlDonkey / mlnet en vez del xmule....
Suerte y espero que nos vayas contando los progresos.
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