Las carpetas no tienen mucho secreto, revisar bien los permisos tanto locales como a la hora de compartir en red.
Lo del segundo server tiene más miga, solución fácil virtualiza tu servidor RDP entero y haz copias a menudo, si cae lo levantas en otra máquina tirando de copia pero lleva cierto tiempo, depende del tamaño de la máquina virtual y el hardware de backup, conexión de red, etc.
La solución "elegante" y más costosa son dos máquina con Windows Server en alta disponibilidad. Busca información sobre el tema, yo hace tiempo que no lo trasteo y no puedo ayudarte con la configuración, igual otro Eoliano tiene un tutorial a mano.