Hola! bueno, pues antes que nada, decirte que el thunderbird no te leerá los correos de hotmail, ya que Microsoft no quiere que se lean con otra cosa que no sea el outlook.
Para configurar el correo, vete al menú Tools, y despues a Acount Settings. En la ventana que sale, dale al botón Add Account y te saldrá un asistente en el que tienes que poner tu nombre (real o ficticio, el que saldrá cuando envies mails) y tu direccion de correo, le das a siguiente y te pregunta el tipo de cuenta, escoges pop y ya solo queda por introducir los datos pop y smtp. Normalmente suelen ser pop3.tudominio.com para el pop y smtp.tudominio.com para el smtp. Básicamente eso es lo que necesitas, lógicamente, el usuario y la contraseña tambien
Saludos ^^