Si se te calienta el portátil en exceso podría el CPU reducir su velocidad (no entrando el turbo, o incluso reduciendo por debajo de su velocidad base), incluso con el turbo el CPU es bastante faltillo no digamos si reduce. Le estás exigiendo de continuo lo que nunca le habrás exigido hasta ahora, no sería raro problemas de calor en un portátil.
Pon en ventana el emulador y mira con algún programa a ver qué temperatura y MHz maneja el CPU cuando se te viene abajo el rendimiento.
Si no hay ese problema es que irás falto simplemente. Puede haber zonas en los juegos que pidan más que en otras (un efecto gráfico diferente, una carga de trabajo extra internamente, más enemigos, cualquier cosa)