Usa cualquier parcheador genérico de para los ips (winips, por ejemplo). Y probablemente el juego se siga quejando del save, pero cargará y salvará perfectamente (supongo que lo hará, puesto que sólo jugué 3 minutos con el backup)
Y el parche es sólo para un juego específico, pokemon verde hoja español, (o pokemon rojo fuego, dependiendo del parche que escojas), no es compatible con las demás versiones de pokemon.