Lo mas probable es que tengas que formatear la memoricard, eso me pasó a mi la semana pasada y buscando por internet encontre un programa que hay que grabar en un cd, se llama memoricard formatter, pero claro para ejecutarla tu ps2 debe estar chipeada o con swap magic para ejecutarlo.
Saludos.
EDIT: puedes usar otro cd que tienes Action replay MAX (armax), con el cual puedes crear copias de tus partidas gaurdadas, en pendrive, antes de formatearla, aunque a mi la mayoria me decía que no se podian guardar, estarían corruptas. Pero te digo lo mismo, la ps2 debe estar chipeada o con swap magic.
Saludos y suerte.