si lo instalaste con un .wad tendras que quitar ese wad con un wad manager y poner el nuevo. Si el wad era un forwarder (acesso directo) basta con que sobreescribas la nueva version encima de la vieja en tu tarjeta SD.
Vamos, que es lo normal en cualquier app.
Yo el neogamma no uso, pero con uloader, usbloader gx... es asi.
saludos.
