La consola sin cartucho,debe mostrar un pantalla azul(bios),sin ningún tipo de objeto extraño.
Si te muestra fallos sin cartucho,descarta slot.
Lo siguiente a comprobar,es la fuente.Si ya te has asegurado de que no es la fuente(con modelos adecuados tanto en tensión como en amperaje),tienes el problema en la mainboard.
Como curiosidad,te diré que me pasó algo "parecido",tras algún tiempo sin utilizar la fuente original de la neogeo aes.Me pasó que,a veces,los juegos arrancaban como si les fallara la sincronía.Tras un rato probando,quedó claro que el problema era de la fuente.