a mi me paso lo mismo, un dia iba a jugar y de pronto se me borroraron todas las roms mas los saves, de hecho no se borraron todas, solo quedaron como 2, me parecio extraño, revise la microsd en el PC y nada, puse ver archivos ocultos y nada, pero lo mas extraño de todo es que al tiempo volvieron a aparecer, creo que solo un par de rom y saves se borraron de forma definitivia, no se porque paso, pero puede que te pase lo mismo y los archivos vuelvan a aparecer de la nada.