Todo depende compañero.
Si lo que tienes es chip físico, no deberías tenr gran problema, ya que haces un disco de inicio (ya sea evolution o unleash, este último preferido por mí) y reconfiguras los archivos necesarios en las particiones, si es en C pues agregar el evoxdash.xbe o en e, como en los chips viejos, y listo.
En caso de ser chip "virtual" o expoit, se complica la cosa, ya que necesitarás un juego exploitable (léase Splintercell. Mechassault o 007 AUF) original y un gamesave para poder utilizar uno de los numerosos instalers.
Checa cuál es tu caso y postea lo que veas, a ver si así te podemos ayudar eficazmente.
Saludos !
PD. Las puertas ne el ninja gaiden no deben tardar tanto en abrir, ya que termines con todos los enemigos y tomes todos los items que te aparezcan se abrirán.