Es que estas empezando la casa por el tejado:
Un dispositivo de almacenamiento (disco duro, pen,disquete,...) lleva un sistema de archivos. El sistema de archivos es el que hace que se pueda usar y como.
Por ejemplo, un sistema de archivos muy usado hasta ahora en los pens es FAT32. En ese sistema de archivos no podrás meter un fichero que sea mayor de 4GB ya que no lo permite.
Cuando se formatea,lo que se hace es dejar el dispositivo listo para su uso. Si se formatea al sistema de archivos que ya se tenía muchas veces no será distinguible de borrar todo manualmente. Si se formatea de FAT32 a NTFS, se cambia la forma en la que se almacenan los ficheros internamente y varían las limitaciones.
Un dispositivo normalmente no se desformatea (se puede hacer pero es una tontería) y consiste en que no tenga ningun sistema de archivos, lo que hace que ese dispositivo no pueda usarse hasta que no se le vuelva a dar un formato.
Es muy raro encontrase un dispositivo sin formato (o desformateado como tu dices).
Ahora para ejecutar un LiveCD desde un pen lo más sdencillo y comodo es UnetBOOTin.