A ver, lo voy a intentar:
1.Abres la pelicula y en audio y video pones la opcion Direct stream copy.
2.Vas a Go to last Keyframe y eliges el tamaño al que quieres cortar.
3.Cuando te lo seleccione, pones una marca de inicio, vas hasta el final, pones una marca de final, y eliminas un trozo.
4. Ahora lo grabas (IMPORTANTE no borres la pelicula original ni la sobreescribas)
5. Repites el paso 1 y 2
6..Cuando te lo selecciones, pones una marca de (final), vas hasta el principio, pones una marca de inicio, y eliminas el trozo.
7. Repites el paso 4.
8. Compruebas las 2 peliculas que te habrá generado y si están bien las grabas y eliminas el original.
Espero que te haya servido de ayuda, lo de la marca de inicio creo que no se llama aquí, pero no tengo el programa delante no me acuerdo del nombre original