El xell solo funciona con rcas, ya sea video compuesto o ya sea rgb, así que si enciendes con eject (arranca xell) es normal que no te muestre nada por vga ni hdmi.
Comprueba que xbr si te arranca normalmente y puedes jugar y todo te funciona con el cable que tengas por rca, ya sea rgb o por componentes. Si todo te funciona normalmente con esos cables, entonces también debería funcionarte hdmi y vga. Como última medida puedes volver a flashear mediante flash360, pero eso sí asegurandote de que todo lo demás te funciona y se muestra correctamente. Podría ser un problema de mal flasheo, cosas más raras se han visto.
Pero vamos, que por lo poco que explicas, es posible que solo te arranque xell o xellous y por eso no te va.
Saludos y suerte.