Claro que se borra, es que en realidad no es que se borre, me explico.
El dev_blind, es como un acceso a la flash, que hace que se pueda editar, cuando reinicias la consola, el acceso se pierde, pero los archivos que modificaste no se pierden, lo de los certificados no hace falta que lo agas cada vez que reinicias la consola, con que lo agas 1 vez es suficiente.
Si te fijas, todos los archivos que te metes, se guardan en dev_flash, la carpeta dev_blind es como si no existiera, es solo un acceso.