El HDLoader , como casi todos los discos no oficiales de Sony, esta grabado muy mal y con muchas protecciones, con lo cual es normal que se de el caso de que la lente te lea perfectamente los juegos originales y luego no te pille el SM o el HDL.
Prueba a poner la PS2 en vertical y si no abrela y limpia la lente, en ultimo caso calibra, pero si t lee todo menos el HDLoader yo optaria por instalar el HDLoader en la MC y cargarlo con un juego de la ps1.
SaludoS