a mi me pasa algo parecido, enciendo la consola con el boton ps y automaticamente el mando pasa a estar en "posicion" 2
entonces para jugar y poder utilizar el sixaxis tengo, al empezar el juego, pulsar boton ps, y en ajustes de mando o algo asi, volver asignar el mando y ponerlo en posicion 1
hablo de memoria, y probablemente las cosas no se llamen así pero basicamente es eso
seguro que hago o hice algo mal con el mando, pero eso es lo que tengo que hacer para ponerlo en posicion 1