¡Hola Doomhead!
Tengo unas preguntas cuales quisiera que me aclararas:
1. ¿Cuál es el tipo de Windows que quieres utilizar en tu máquina?
2. ¿Es de 32 o de 64 bits?
3. ¿De cuántos gigas es tu disco duro?
4. ¿Tienes otros discos duros instalados en tu ordenador?
Puede que el disco duro tenga daños pero antes de darlo por fallecido, intenta borrarlo a ceros e intentar de instalar el Windows a limpio. Antes de hacerlo, te recomiendo hacer una copia de seguridad de los ficheros cuales puedes acceder mediante el Ubuntu en un lugar distinto. Si tienes más de un disco duro, te recomiendo desenchufar los todos. Luego intenta de instalar otra vez el Windows al disco que quieres, pero cuando te pregunte dónde instalar el sistema operativo, abre el Símbolo del sistema y ejecuta los siguientes comandos:
diskpart
list disk
select disk 0 si tienes más de un disco debes elegir cuidadosamente cuál es el disco donde quieres instalar el windows.
clean
Debería darte indicación que el DiskPart ha sucedido hacer el cleaning. Entonces dbes dar formato a tu disco antes de instalar el Windows y si es menor de 2.2 TB, dale formato de MBR.
Espero haberte ayudado. Dime qué sucedió. Saludos.